生命学院开发人工智能算法SPACE用于空间转录组数据分析
新清华 2024年07月05日 第2333期 学术前沿
本报讯 如何有效地利用空间位置信息来揭示复杂组织中细胞的空间排列模式和相关的生物学功能,即识别空间细胞亚型和发现组织模块,是空间转录组数据分析的核心任务。近日,清华大学生命科学学院、结构生物学高精尖创新中心、清华-北大生命科学联合中心张强锋副教授课题组在《细胞·系统》(Cell Systems)期刊上在线发表题为“基于感知细胞-细胞相互作用的细胞嵌入在单细胞分辨率空间转录组数据中发现组织模块”的研究论文。在该研究中,团队开发了基于图自编码器深度学习框架的人工智能算法SPACE,可以在空间转录组数据中识别空间细胞亚型和发现组织模块。
张强锋为该论文的通讯作者,生命学院2019级博士生李雨哲和博士后张劲松为共同第一作者。
(生命学院)